مرکز تحقیقات سلامت معنوی  با هدف توسعه تحقیقات پاسخگو و فناور محور ادغام شده با فرایند آموزش و ارائه خدمات حوزه سلامت معنوی در نظام سلامت و سیاست گذاری و برنامه ریزی در راستای  دستیابی به مرجعیت علمی در حوزه سلامت معنوی در سال 1395 موافقت اصولی دریافت نمود

رسالت این مرکز انجام سیاست گذاری، برنامه ریزی، نظارت و ارزشیابی کلیه فعالیت های پژوهشی و فناوری و کاربردی در راستای ارتقای سلامت معنوی جامعه منطبق با اسناد بالادستی و با استفاده از آموزه­های اسلامی جهت بکارگیری در سطوح ملی و فراملی است. این مرکز وظیفه کشف و جذب دانش و فن آوری نو در زمینه سلامت و مراقبت معنوی توسعه دانش سلامت معنوی، انجام پژوهش های بین رشته ای مرتبط با حوزه سلامت و دین، توانمندسازی دانشجو و استاد در زمینه سلامت معنوی، فراهم سازی زیرساخت مناسب و با کیفیت پژوهشهای سلامت معنوی در دانشگاه و تعاملات ملی و بین المللی.، برای ایجاد همکاری وحمایت های عملی، برگزاری دوره های مختلف و ایجاد فرصت های مطالعاتی را بر عهده دارد.

خطوط پژوهشی مرکز شامل : سلامت معنوی، سرمایه معنوی، رشدمعنوی، مراقبت معنوی، رفاه معنوی، بحران معنوی، مشاوره معنوی